Protein–RNA interactions for Protein: O35176

Scgb1b2, ABPA2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b2O35176 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b2O35176 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b2O35176 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scgb1b2O35176 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scgb1b2O35176 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms