Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ncoa3O09000 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ncoa3O09000 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncoa3O09000 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncoa3O09000 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncoa3O09000 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ncoa3O09000 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ncoa3O09000 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms