Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PbsnO08976 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PbsnO08976 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PbsnO08976 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PbsnO08976 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PbsnO08976 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PbsnO08976 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PbsnO08976 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PbsnO08976 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PbsnO08976 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PbsnO08976 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PbsnO08976 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PbsnO08976 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PbsnO08976 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms