Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn2O08746 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn2O08746 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Matn2O08746 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn2O08746 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Matn2O08746 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn2O08746 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn2O08746 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn2O08746 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn2O08746 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn2O08746 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms