Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8050L7N2E3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8050L7N2E3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8050L7N2E3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8050L7N2E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms