Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vwa3bJ9JI28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vwa3bJ9JI28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vwa3bJ9JI28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Vwa3bJ9JI28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Vwa3bJ9JI28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vwa3bJ9JI28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms