Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8298J3QPI0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8298J3QPI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8298J3QPI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm8298J3QPI0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm8298J3QPI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms