Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Ccdc180J3QNE4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Ccdc180J3QNE4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Ccdc180J3QNE4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
Ccdc180J3QNE4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Ccdc180J3QNE4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Ccdc180J3QNE4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ccdc180J3QNE4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ccdc180J3QNE4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms