Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20918J3QN17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20918J3QN17 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20918J3QN17 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20918J3QN17 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20918J3QN17 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20918J3QN17 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20918J3QN17 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20918J3QN17 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms