Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem200cJ3QK46 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem200cJ3QK46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem200cJ3QK46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem200cJ3QK46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem200cJ3QK46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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