Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34c3J3QJW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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