Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf4bG5E8Z2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf4bG5E8Z2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Taf4bG5E8Z2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf4bG5E8Z2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms