Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pabpc4lG5E8X2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pabpc4lG5E8X2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc4lG5E8X2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms