Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E230025N22RikG5E8S3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E230025N22RikG5E8S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E230025N22RikG5E8S3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E230025N22RikG5E8S3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E230025N22RikG5E8S3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E230025N22RikG5E8S3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E230025N22RikG5E8S3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E230025N22RikG5E8S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E230025N22RikG5E8S3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms