Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh19G5E8H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh19G5E8H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh19G5E8H9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh19G5E8H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rdh19G5E8H9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms