Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sclt1G5E861 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sclt1G5E861 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sclt1G5E861 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sclt1G5E861 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms