Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pcf11G3X9Z4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pcf11G3X9Z4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Pcf11G3X9Z4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pcf11G3X9Z4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Pcf11G3X9Z4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pcf11G3X9Z4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcf11G3X9Z4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms