Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Obox6G3X9U1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Obox6G3X9U1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Obox6G3X9U1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Obox6G3X9U1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Obox6G3X9U1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Obox6G3X9U1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms