Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nkx1-1G3UXB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nkx1-1G3UXB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nkx1-1G3UXB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nkx1-1G3UXB3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx1-1G3UXB3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx1-1G3UXB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nkx1-1G3UXB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms