Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn34aG3UW52 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn34aG3UW52 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn34aG3UW52 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn34aG3UW52 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms