Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdh9F8VPK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh9F8VPK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdh9F8VPK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh9F8VPK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh9F8VPK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms