Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm7535F7CXE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm7535F7CXE4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm7535F7CXE4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7535F7CXE4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7535F7CXE4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms