Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdh11xF6ZNL5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcdh11xF6ZNL5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcdh11xF6ZNL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcdh11xF6ZNL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms