Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8220F6YKI2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8220F6YKI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8220F6YKI2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms