Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm17093F6XGJ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm17093F6XGJ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms