Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SmgcF6VRN1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmgcF6VRN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmgcF6VRN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmgcF6VRN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmgcF6VRN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmgcF6VRN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms