Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28374F6SG70 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28374F6SG70 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28374F6SG70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms