Protein–RNA interactions for Protein: F6R3J9

Gm8879, Predicted gene 8879, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8879F6R3J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8879F6R3J9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8879F6R3J9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm8879F6R3J9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm8879F6R3J9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8879F6R3J9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms