Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa35E9QLQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa35E9QLQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa35E9QLQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa35E9QLQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa35E9QLQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms