Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmod3E9QA62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod3E9QA62 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod3E9QA62 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod3E9QA62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms