Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UtrnE9Q6R7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UtrnE9Q6R7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UtrnE9Q6R7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UtrnE9Q6R7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UtrnE9Q6R7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UtrnE9Q6R7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UtrnE9Q6R7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1153.8 ms