Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ythdc1E9Q5K9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ythdc1E9Q5K9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ythdc1E9Q5K9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ythdc1E9Q5K9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ythdc1E9Q5K9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms