Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610021A01RikE9Q0Q3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
2610021A01RikE9Q0Q3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610021A01RikE9Q0Q3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms