Protein–RNA interactions for Protein: E9PZV8

1810032O08Rik, RIKEN cDNA 1810032O08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810032O08RikE9PZV8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1810032O08RikE9PZV8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1810032O08RikE9PZV8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1810032O08RikE9PZV8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1810032O08RikE9PZV8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms