Protein–RNA interactions for Protein: E9PZG0

Apol11a, Apolipoprotein L 11a, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11aE9PZG0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol11aE9PZG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol11aE9PZG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol11aE9PZG0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol11aE9PZG0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol11aE9PZG0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms