Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
4931408C20RikE9PWP9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4931408C20RikE9PWP9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
4931408C20RikE9PWP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
4931408C20RikE9PWP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms