Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim30dE9PWL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim30dE9PWL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim30dE9PWL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30dE9PWL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trim30dE9PWL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim30dE9PWL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms