Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Abca16E9PWJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Abca16E9PWJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Abca16E9PWJ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Abca16E9PWJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Abca16E9PWJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abca16E9PWJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Abca16E9PWJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Abca16E9PWJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abca16E9PWJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms