Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp944E9PUS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp944E9PUS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp944E9PUS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp944E9PUS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms