Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Soga1E1U8D0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Soga1E1U8D0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Soga1E1U8D0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Soga1E1U8D0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Soga1E1U8D0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Soga1E1U8D0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Soga1E1U8D0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Soga1E1U8D0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Soga1E1U8D0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Soga1E1U8D0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Soga1E1U8D0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms