Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6ap1lD3Z5W0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms