Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc13D3YV10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc13D3YV10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc13D3YV10 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc13D3YV10 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms