Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccnyl1D3YUJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnyl1D3YUJ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnyl1D3YUJ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnyl1D3YUJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccnyl1D3YUJ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms