Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx8D3YU81 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx8D3YU81 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rfx8D3YU81 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx8D3YU81 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx8D3YU81 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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