Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FanceB8JJD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FanceB8JJD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FanceB8JJD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanceB8JJD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanceB8JJD6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms