Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrr3B2RXA8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Gabrr3B2RXA8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabrr3B2RXA8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabrr3B2RXA8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabrr3B2RXA8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms