Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprbB2RU80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprbB2RU80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprbB2RU80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprbB2RU80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms