Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrt4B2RU40 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrt4B2RU40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrt4B2RU40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt4B2RU40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt4B2RU40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt4B2RU40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt4B2RU40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrt4B2RU40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms