Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Plekhd1B2RPU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Plekhd1B2RPU2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Plekhd1B2RPU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Plekhd1B2RPU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plekhd1B2RPU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plekhd1B2RPU2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Plekhd1B2RPU2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms