Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Col4a6B1AVK5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col4a6B1AVK5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a6B1AVK5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a6B1AVK5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a6B1AVK5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms